Ο Βρετανός Danny Kent, ο οποίος είχε κερδίσει τον αγώνα της Ιαπωνίας το 2012 στη Moto3, έφυγε από το Motegi με τον καλύτερο χρόνο της ημέρας, πετυχαίνοντας 1:57.317 και κατεβάζοντας το δικό του απόλυτο χρόνο του 2012 για πάνω από ένα δευτερόλεπτο!
Ο ανταγωνισμός όμως πλησίασε τον Danny Kent, με τον Alex Rins (Honda) να μένει πίσω από τον Βρετανό για μόλις 58 χιλιοστά και τον Miguel Oliveira να είναι τρίτος με ένα δέκατο διαφορά από την κορυφή. Την πεντάδα έκλεισε ο Brad Binder και ο Enea Bastianini.
Ιδανικές οι συνθήκες στην Ιαπωνία, σε αντίθεση με την περσινή χρονιά που είχε βροχή και έντονη ομίχλη, με κανέναν από τους οδηγούς της μικρής κατηγορίας να μην πέφτει από τη μοτοσυκλέτα του. Οι συντριπτικοί πλειοψηφία μάλιστα, κατάφερε να βελτιώσει τους χρόνους της από το πρωί (ΕΔ1).